26.02.2021
Сообщество бактерий, вирусов и других микроорганизмов, обитающих в кишечнике человека, известно как кишечная микробиота.
Ученые знают, что кишечные бактерии напрямую влияют на здоровье и болезни. Эти бактерии влияют на обмен веществ, иммунную и нервную системы. В некоторых случаях они вызывают широкий спектр заболеваний и состояний, включая недоедание, болезни сердца, ожирение и рассеянный склероз.
Ученые гораздо меньше знают о кишечных бактериофагах, вирусах, поражающих эти бактерии, хотя их влияние на здоровье человека, вероятно, будет столь же значительным.
Помимо регулирования размеров популяции различных видов бактерий в кишечнике, бактериофаги управляют эволюционными изменениями бактерий, передавая гены от одного вида к другому.
Однако разнообразие вирусов, обитающих в кишечнике человека, их распространенность и их влияние на здоровье человека остаются в значительной степени неизвестными.
Чтобы восполнить этот пробел в знаниях, ученые из Института Велкома Сэнгера и Европейского института биоинформатики в Хинкстоне, Великобритания, создали, по их мнению, самую полную коллекцию геномов кишечных фагов человека в мире.
Они идентифицировали и классифицировали вирусную ДНК в 28 060 « метагеномах » кишечника человека, которые представляют собой коллективные генетические последовательности целых сообществ организмов, живущих внутри людей. Метагеномы пришли со всего мира.
Они также проанализировали геномы 2898 различных штаммов изолированных и культивированных кишечных бактерий человека.
Их база данных кишечных фагов в настоящее время содержит более 140 000 различных вирусных геномов, более половины из которых ранее были неизвестны науке.
Большинство образцов, проанализированных командой, были получены от здоровых людей. Вирусы, идентифицированные командой, в основном используют ДНК в качестве генетического материала, в отличие от патогенов, таких как SARS-CoV-2 или Zika, которые используют РНК.
«Важно помнить, что не все вирусы вредны, но представляют собой неотъемлемый компонент экосистемы кишечника», - говорит один из исследователей, доктор Александр Алмейда, научный сотрудник Европейского института биоинформатики и Института Велкома Сэнгера.
«Удивительно видеть, сколько неизвестных видов обитает в нашем кишечнике, и пытаться выяснить связь между ними и здоровьем человека», - добавляет он.
Другие ученые смогут использовать новую базу данных для исследования того, как вирусы влияют на «микробиом кишечника» - коллективный геном всех микроорганизмов в кишечнике - и, следовательно, на здоровье человека. Например, это может привести к разработке методов лечения на основе бактериофагов , нацеленных на болезнетворные кишечные бактерии.
«Высококачественные вирусные геномы открывают путь к лучшему пониманию роли вирусов в нашем кишечном микробиоме, включая открытие новых методов лечения, таких как противомикробные препараты бактериофагового происхождения», - объясняет первый автор Луис Ф. Камарилло-Герреро из Института Велком Сэнгера.
База данных - это еще один шаг на пути к выявлению связи между микробиомом кишечника и образом жизни, возрастом и заболеваниями человека.
Исследование, опубликованное Medical News Today в 2020 году, показало, что сообщества вирусов в кишечнике сильно различаются и, вероятно, уникальны для каждого человека.
Новое исследование предполагает, что состав кишечных фагов также зависит от образа жизни. Ученые обнаружили, что фаги людей, живущих в городских районах, как правило, нацелены на бактериальный род Bacteroides . Напротив, люди из пригородных районов (из сельской местности и сообществ охотников-собирателей) отдавали предпочтение семейству бактерий под названием Prevotellaceae.
Исследование также показало, что, хотя большинство кишечных бактериофагов могут инфицировать только один вид бактерий, около 36% могут инфицировать множество различных видов.
Эти широкие вкусы могут позволить им переносить бактериальные гены между отдаленно родственными видами в кишечнике человека, говорят авторы. Это могло бы способствовать быстрому распространению эволюционных адаптаций в микробиоме.
Сеть аптек "Формула Здоровья" © 2014 - 2024
ООО "Формула Здоровья".
Данный информационный ресурс не является публичной офертой. Наличие и стоимость товаров уточняйте по телефону. Производители оставляют за собой право изменять технические характеристики и внешний вид товаров без предварительного уведомления. Размещенная на сайте информация: описания лекарственных средств, БАДов и других товаров, носит исключительно ознакомительный характер и не может использоваться для самолечения.